抗戰勝利以后，戴笠挖空心思搶奪勝利果實，不知道是因為作惡多端，還是命里注定。1946年3月17日，因飛機失事，撞死在岱山，這個搞了大半輩子特務活動的曠世奸雄，一向夸口他的情報網不但遍布全國，還遍及全球五大洲，而結果他被摔死之后，在特務密布如麻的南京附近地區，暴尸3天之后才被發現。

抗戰勝利消息的傳來，使戴笠既興奮又有些茫然，盡管他很清楚，日本一投降，中共就成了主要敵人。他命令各特務武裝集結待命，同時，命令岡村寧次不要向中共繳械。老蔣暗中命令戴笠，盡全力接收上海，維持京滬地區治安，整肅漢奸，處理偽軍，等候中央軍隊到來。戴笠首先命令忠義救國軍淞滬地區指揮阮清源，連夜率部隊向無錫太湖一帶及吳淞一帶挺進;令集結在溫臺區的忠義救國軍，及軍統海上行動總隊以及中美所訓練班的三個教導營進占崇明、浦東;令中美所參謀長李崇詩，率部向上海市區推進;派軍統京滬行動總隊等向南京近郊挺進。命令發出之后，把又與杜月笙一起徹夜密商，讓杜月笙把其門徒、幫會把兄弟以及陸京士等掌握的勞工，迅速潛回上海。同時下令孫良誠等偽軍，效忠中央，抵制共產黨及新四軍。一切安排妥當之后，戴笠便以軍委會的名義頒發大批委任狀給各地偽軍。戴授予周佛海為上海市行動總指揮，讓周把他掌管的偽稅警團，偽保安部及偽軍集結起來，臨時負責維持上海治安，阻止中共地下黨在上海進行活動，保存好偽中央銀行的全部財產。

9月初，戴笠抵達上海。唐生明和在上海的軍統特務大小頭目一起趕到機場迎接。戴一下飛機，就忘情地抱住唐生明。這天晚上，戴笠才正式告訴唐自己到上海的任務，他要在美國海軍的支持下重建中國海軍。戴笠在上海灘除搶收財產外，最感興趣的還是日偽的特警機構和社會公職機關。因為他清楚，抗戰結束后，軍統局勢必壓縮精減機構，他手下的十萬戰將，職業和出路都將是個大問題。然而，在這“五子登科”搶收勝利成果之際，其他系統的人也都想在上海這個首屈一指的重地插上一腳，這就勢必發生“撞車”現象。戴笠垂涎已久的上海警察局長一職，被黃埔一期的宣鐵吾奪得;上海社會局長，被吳紹澍掠走。此人最早為陳立夫部屬，后又拜杜月笙為師，是個野心勃勃、反復無常的小人。

吳紹澍掌握了上海黨、政、團的大權，便向首屈一指的青幫大亨杜月笙開刀。杜返回上海，剛一下火車，吳已派人在火車站貼滿了“打倒惡勢力！”“杜月笙是惡勢力的代表！”“打倒杜月笙”等標語。杜氣得要死將此事說給了戴笠，戴決定整治他，以平心頭惡氣。不久，軍統特務發現，吳曾接收了上海巨富邵式軍在愛棠路的豪華住宅，并將其改為國民黨上海特別執行委員會的辦公場所，貪污了四個保險箱，價值數億元。戴笠據此向老蔣做了匯報。蔣電令，免去吳一切職務，戴才算出了這口惡氣。戴笠在上海布置一下以后，又匆匆趕到北平和天津，同樣是有大批漢奸去迎接和為他工作。他整天與大群漢奸觥籌交錯，各方面紛紛提出指責和控訴。當時他的一個要好的朋友、東北四公子之一的吳幼權，和華北經濟方面負責的大漢奸汪時璟等人，成為他搶劫華北的重要顧問。由于戴笠在各地親自主持劫收活動，因此派往各地的大小特務也無不上行下效，大搶特搶。搶奪之風鬧得太大了，戴笠也感到有點不妥，決定讓毛人鳳成立一個財產清理委員會。實際上等他摔死以后，這個委員會才開始工作。

大漢奸周佛海和他的妻子楊淑慧，住在重慶軍統局辦的四一醫院，正為他們一家人的性命和前途擔憂。“我看咱們都被戴雨農騙啦！你們為他們干了那么多好事，到頭來還是被關押起來！”楊淑慧滿面愁容的對躺在病床上的周佛海說。“誰讓我走錯了這步棋啊！不過，雨農還不是個過河拆橋的人，就怕委員長……”這個作惡多端的大漢奸，此刻也感到巨大的恐懼。原來，周佛海協助戴笠安定上海、南京等地的局勢，并協助戴完成了肅奸工作，以為可以“將功折罪”，誰知還是被軟禁在了重慶。那天，戴笠突然來訪周，雖然還像往常一樣稱兄道弟，但說出來的話卻讓人心驚膽戰，“佛海兄，目前京滬地區的謠傳很多，都說我們‘翻手為云，覆手為雨’。委員長的意思是想請你們一同到重慶，先休養一段時間……”

“雨農，委員長莫非要……”周佛海情急地問。戴笠笑道：“佛海兄，放心好啦！只要有我戴雨農在，就有你周佛海。到適當的時候，我會出面為你作證的……”周佛海亦無可奈何，只好招集自己的親信，轉達戴笠的話。他故意強調“休養”二字，并說這是為保護他們的“權宜之計”。羅君強、丁默邨等人聽了非常高興，豈不知這是戴笠的“誘捕之計”。到重慶后，戴也去探望過他們，但對周的要求，卻含糊其詞。戴不過是想騙取他們的信任。戴笠此時正在考慮華北的肅奸工作。華北地區是日偽的老巢，情況復雜，秩序混亂，又沒有一個像周佛海那樣的人做內應，加上華北共產黨八路軍的聲勢還很浩大，蘇聯紅軍也曾一度進軍張北，蔣軍對八路軍的進攻也遭到了打擊。這一切，都不能不使戴笠提心吊膽、謹慎行事。戴笠一到北平，就由十一戰區調查室主任張家銓陪同，拜訪了十一戰區司令孫連仲、北平行營主任李宗仁、北平警備司令陳繼承等軍隊長官，以獲取他們的協助與支持。然后，利用他的酒肉朋友——“東北四公子”之一吳幼權，暗中說服了偽財政總長兼偽華北儲備銀行總裁汪時璟，讓他協助肅奸，以“將功折罪”。惶惶不可終日的漢奸們，此時能抱住戴笠這棵大樹，自然求之不得，怎敢不盡心盡力。

12月6日，冷落多日的西單粉子胡同汪時璟公館突然熱鬧起來。華北地區的大小漢奸們接到汪的“家宴”請柬，以為有什么要事，便都來聚會，也想在一起商討一下對策，以謀生路。誰知觥籌交錯，酒興正酣之際，全副戎裝的戴笠突然出現，再一看客廳內外，不知何時，已然站滿了荷槍實彈的便衣特務，漢奸頓時酒意全消，各個目瞪口呆，一片死寂。戴笠莊嚴宣布：“我代表國民政府肅奸委員會逮捕你們，聽候國法審理……”漢奸們已嚇得魂飛魄散，面如土色，王克敏竟然被嚇昏過去了。戴笠沒想到肅奸工作如此順利，對汪時璟格外感激，表面上也把汪押到了北平炮局子監獄，不久就將送往重慶軟禁，生活給予最優惠的照顧。受到戴笠關照的漢奸還有李守信、黃順柏等人，亦是圖其日后之用。廣東的肅奸工作也是在戴的指揮之下進行的。廣東是汪精衛的老巢，勢力很大，他雖已病死在日本，但其妻陳璧君仍繼續頑抗，拒不投降。

戴笠仍是先籠絡親信，他以老蔣的名義寫信給偽廣東省省長褚民誼，此人是汪的死黨。戴笠的信措辭委婉，以極為誠懇的態度，邀他們到重慶，共商廣東善后事宜，顯示出不計前嫌的大將風度。褚回信表示愿意勸說陳璧君，一同赴渝。褚心里清楚，失去日本靠山，廣東是維持不下去的，不如借坡下驢，也許還有一線生機。這樣，陳璧君也放棄了抵抗，決定和談。戴笠命令潛伏在廣州的特務在去機場的路上打好埋伏，陳、褚二人的汽車一到，特務們蜂擁而上，將他們逮捕，騙過廣東偽軍的視線，秘密押往南京。陳、褚二巨頭被捕以后，廣東的大小漢奸及偽軍，便紛紛投降了。

到此，戴笠的肅奸任務已算告一段落。但他必須全力以赴地投入到另一場戰爭中去，為了名利權勢。戴笠在北平度過了1946年的春節。然而，熱鬧的春節使他備覺冷清，有黯然神傷之感。他莫名其妙地覺得，這一年凡事都將不順。戴是個很迷信的人。戴笠很相信風水、命相一類東西。軍統修建房屋時，大門應向哪一方向開，前后左右應注意哪些地方是龍脈，以及宜于建陽宅或陰宅等問題，他經常親自下指示，不能弄錯，否則雖已動工也得停止。軍統所辦的許多基本特務訓練班內，他規定要開設命相一類課程，把曾國藩所用以作為取舍部屬標準的一本《冰鑒》和麻衣、柳莊等相法編成教材。軍統的一些大特務也都跟他一樣，非常相信這套東西。

由于算命的先生說戴笠命中缺水忌土，所以軍統局局本部在抗戰期間使用的化名，總是用一些水汪汪的名字來補他的命中之不足，如江漢清、汪濤、涂清波、沈沛霖、洪淼等。而其中用得最久的沈沛霖，因為自從用了這個化名，他的事業更是一帆風順，如日中天，他便破格幾年不換，認為是這個化名起的好。他對化名的選擇很認真，到1944年，秘書室認為沈沛霖用得太久怕不妥當，擬了新化名洪淼，這比沈沛霖含得水更多，他才答應改用。但1945年年底擬1946年化名時，他不在重慶，秘書室助理袁寄濱偏不相信這些，故意擬了一個缺水而多山的化名高崇岳，想看看究竟會怎樣，毛人鳳也馬馬虎虎地批準了。不料事有偶合，戴這年就因飛機撞山而死。

戴還深受外國迷信的毒害。歐美人士最忌諱“13”這個數字，他一生也最怕“13”對其不利。戴之迷信，于此可見。戴精神恍惚的過完春節，他的心情極為煩悶，惟恐蔣介石將他一腳踢開。一天晚上，他找文觀濤(文強)來商議事情。他憂郁低沉地說：“伴君如伴虎。”他這個作奴才的也并非一帆風順，曾幾次到了要被“賜死”的地步。例如：汪精衛逃河內，搶先作了投降求和的先鋒，戴派人行刺，錯殺了曾仲鳴;同年刺殺唐紹儀又露了馬腳。特別是他手下的劊子手趙理君在洛陽活埋了C.C系的行政督察專員韋名芳等五人一案，鬧得滿城風雨，C.C系群起而攻之。還有在昆明殺皇親國戚孔二小姐的情人林世良一案，幸有陳布雷說情，才得免死。再有他知道蔣介石的秘密和見不得人的事太多了，很擔心一旦蔣為了保全自己的秘密，置他于死地。他也知道什么是狡兔死走狗烹，每聽到別人說起歷代暴君對寵臣的殺戮，就會生起兔死狐悲之感。

這天上午，他突然接到由毛人鳳轉來的電報，大意是催他火速趕回重慶，參加有關情報機構的整頓會議，大有撤銷或改組特務機構之勢。電報中列名出席會議的有八人，即：宣鐵吾、陳焯、李士珍、黃珍吾、葉秀峰、戴笠、鄭介民、唐縱。電文后面有毛人鳳的附注“重慶宣、李、黃在搗鬼，謹防端鍋，請親自呈復”。文觀濤的到來正是為了此事，戴此時已沉不住氣了，拍著胸脯說：“我辛辛苦苦在外面奔波勞累，一心為校長為國，想不到會有人搗鬼，落井下石，想端我的鍋。同室操戈，實在欺人太甚！請為我擬一復電，說我處理平津寧滬的肅奸案件，事關重要，無人可代，請寬限半月才能返渝面陳一切。同時要表達對宣、李搗鬼必須揭發的意見，措辭要委婉一些，不要露出與人爭長短的痕跡。”

李士珍與戴笠爭奪警政大權，早在復興社特務處成立之初就開始了。戴認為李是他手下的敗將。而宣鐵吾在抗日戰爭中期，奪去財政部緝私署長一職，讓戴很忌恨。這次，李又聯合宣鐵吾和南京警察廳長黃珍吾，向他反攻，并搬出國民黨元老戴季陶做后臺，這不能不令戴氣急敗壞。接下來，戴又問文：“你從形勢上看，我們的團體前途怎樣？”文觀濤沉思片刻，便說：“整個形勢對于我們團體不利。不過，無論怎么變，‘剿共’是校長的既定方針，特務工作是少不了的。另外，與美國搞好關系也是校長的必由之路。目前，惟一的對策是以退為進。”戴笠略微思索了一下，問：“什么是‘以退為進’？”“以校長之英明，北伐以來就有過三次下野。你不妨以出國考察為由，暫避風頭，等內戰……”戴笠未等文說完，一拍桌子，“不行！警政大權我決不讓給李士珍，一定要爭取到手！”他嘴上這么說，心理也盤算著“下野”。

以后幾天，戴笠向鄭介民把自己“引退”的事情交代清楚，于3月17日從天津起身，先飛往上海，與胡蝶見一面，再回重慶。當天，接到上海方面氣候不好的通知，大家都勸戴改日再走。但他卻堅持走，并要求多帶汽油，上海不能降落就飛南京。上午9時，飛機從天津起飛，飛近上海時，正值大雨滂沱，機場不同意降落，只得改飛南京。當時，南京也下大雨，勉強同意降落。但到下午1點6分后，電訊突然中斷。此時，這架專機已撞在江寧板橋鎮南面的岱山山腰上。隨著一聲巨響，戴笠這個作惡多端、不可一世的軍統頭子，便這樣結束了生命。17日晚，毛人鳳急電青島、上海、南京查詢戴的下落，但均無消息。第二天，向蔣介石匯報了情況。此刻，南京辦事處主任劉啟瑞，正在率部屬在南京附近搜尋，未得結果;19日早，又兵分兩路，出發尋找。他們從一農民口中得知，兩天前有一架飛機，在板橋區撞山而墜。當時天氣惡劣，雷雨交加，云層也極低，能見度非常差，飛機降落時，竟越過機場，撞到岱山山腰。這天傍晚，他們終于找到戴笠的遺骸。這遺骸只是半截“黑炭”，小腿和一只胳膊，早不知去向了，只有嘴里那六顆金牙和衣服殘片，證實是戴的遺骸。

拋尸“困雨溝”三日，讓老蔣感到很傷心，他親贈挽聯，“雄才冠群英山河澄清仗汝跡，奇禍從天降風云變幻痛予心。”是年8月，蔣親到紫金山靈谷寺，為戴選擇墓地，并叮囑毛人鳳，一定要在子午時下葬。1947年3月，軍統選了一個吉日安葬了戴笠。在下葬前，毛人鳳讓沈醉設法把棺材弄得特別結實，使別人無法打開。沈醉決定用水泥炭渣攪拌灌在墓穴內，使棺木與整個墓穴凝結成為一大塊，這樣棺材就不易被打開。毛人鳳是怕戴生前作惡太多，死后被人鞭尸。戴笠暴死，軍統局群龍無首，立時陷入一片混亂之中。鄭介民、唐縱、毛人鳳三人展開了爭權奪利、拉幫結派的斗爭。當時，鄭介民被委任為代理局長。1946年10月，軍統局被撤銷，成立保密局。至1949年12月，這個組織在大陸徹底消亡。